Skyrius, įgyvendindamas nurodytus uždavinius, atlieka šias funkcijas:

6.1. organizuoja ir vykdo Agentūros veiklos rizikų valdymo priežiūrą:

6.1.1. padeda Agentūros vadovybei bei darbuotojams vykdyti priskirtas atsakomybes rizikų valdymo srityje;

6.1.2. apibendrina Agentūros rizikų valdymą detalizuojančius dokumentus;

6.1.3. rengia, tobulina ir koordinuoja rizikų identifikavimo ir vertinimo procesus;

6.2. atlieka vidaus kontrolės įgyvendinimo priežiūrą, vidaus kontrolės analizę bei vertinimą;

6.3. koordinuoja Agentūros Procedūrų vadovo ir naujų vidaus tvarkų bei kitų dokumentų, susijusių su projektų administravimu, rengimą ir koregavimą:

6.3.1. organizuoja ir vykdo veiklos procesų matavimo, analizės ir gerinimo veiklas;

6.3.2. organizuoja Agentūros veiklos procesų kūrimą ir diegimą;

6.3.3. koordinuoja Agentūros veiklos procesų tinkamą dokumentavimą bei konsultuoja jų rengimo bei taikymo klausimais;

6.3.4. kuria Agentūros veiklos gerinimo procesus ir palaiko nuolatinio veiklos efektyvinimo kultūrą;

6.4. valdo neatitiktis, korekcinius ir prevencinius veiksmus:

            6.4.1. identifikuoja Agentūros teikiamų paslaugų ir veiksmų neatitikimus nustatytiems reikalavimams;

6.4.2. atlieka neatitikčių, korekcinių ir prevencinių veiksmų analizę;

6.5. pagal kompetenciją rengia ir (arba) dalyvauja rengiant, ir (arba) teikia pastabas dėl norminių teisės aktų projektų bei atlieka vidaus tvarkų atitikties vertinimą;

6.6. vykdo su korupcijai atsparios aplinkos kūrimu Agentūroje susijusią veiklą;

6.7. dalyvauja diegiant ar (ir) taikant naujus vadybos sistemų metodus;

6.8. pagal kompetenciją rengia duomenis strateginiam planui ir veiklos planams bei ataskaitoms;

6.9. vadovaujančiosios institucijos prašymu teikia derinti pagal kompetenciją rengiamus su vadovaujančiosios institucijos atsakomybe atliekamų funkcijų įgyvendinimu susijusių dokumentų, reglamentuojančių veiksmų programos įgyvendinimą, projektus.